Доказательства эволюционного происхождения млекопитающих от древних пресмыкающихся основаны на множестве анатомических, эмбриологических, генетических и палеонтологических данных. Одним из ключевых доказательств является сходство в строении костей черепа, особенно в области уха. У млекопитающих и пресмыкающихся имеется общий происхождения ушной кости, которая со временем эволюционировала во внутреннее ухо у млекопитающих.
Другим важным доказательством является сходство в строении зубов. У пресмыкающихся и древних млекопитающих были зубы, похожие на конусы, но у последних они стали разнообразнее и сложнее для лучшей адаптации к разнообразной пище.
Также сравнение эмбрионального развития у млекопитающих и пресмыкающихся показывает сходства в процессах формирования органов и систем организма.
Палеонтологические находки также подтверждают эволюцию млекопитающих от древних пресмыкающихся. Например, археоцеты – древние млекопитающие, имели множество черт, характерных для пресмыкающихся, но с признаками, свойственными млекопитающим.
Таким образом, совокупность всех этих доказательств позволяет утверждать, что млекопитающие произошли от древних пресмыкающихся в результате эволюционных изменений и адаптаций к изменяющейся среде обитания.