После того как в результате световой фазы фотосинтеза в клетках хлоропластов образуются молекулы АТФ и НАДФН2, начинается темновая фаза фотосинтеза, или цикл Кальвина. В этой фазе углекислый газ, полученный из атмосферы, превращается в глюкозу и другие органические соединения. Процесс происходит в стоматальных клетках, где находятся рубиско, фермент, катализирующий реакцию фиксации углекислого газа.
В ходе темновой фазы фотосинтеза происходит серия биохимических реакций, в результате которых углекислый газ преобразуется в триофосфат (3-фосфоглицериновую кислоту), которая далее превращается в глюкозу. В процессе образуется также ди- и трифосфоглицериновые кислоты, которые могут использоваться для синтеза других органических соединений.
Таким образом, дальнейшая "судьба" образовавшихся веществ в темновой фазе фотосинтеза заключается в превращении углекислого газа в органические соединения, такие как глюкоза, которые могут быть использованы растениями для роста, развития и обеспечения энергией.