Водные цветочные растения отличаются от водорослей тем, что они имеют определенную структуру и органы: корни, стебель, листья, цветы и семена. Водоросли же представляют собой простые многоклеточные или одноклеточные организмы без определенной структуры и органов.
Водные цветочные растения являются высшими растениями, так как они обладают сложной организацией и имеют развитую систему тканей и органов. Водоросли же считаются примитивными организмами, не обладающими сложной структурой и органами.
Таким образом, основное отличие водных цветочных растений от водорослей заключается в структуре и организации организма, а также в уровне развития и классификации в растительном мире.